Whole exome sequencing (WES) is een moleculair genetisch proces dat kan worden gebruikt om veranderingen in genen te identificeren. Deze methode is relatief nieuw, en naarmate de technologie snel vordert, wordt verwacht dat verder onderzoek en de ontdekking van meer praktische klinische doeleinden zullen ontstaan.
Genetische tests worden erg populair - u kunt producten kopen die uw haar of speekselmonsters gebruiken om bepaalde genetische eigenschappen vast te stellen en om te ontdekken welke etnische achtergronden deel uitmaken van uw afkomst.
WES is een beetje anders dan dit soort genetische tests omdat het wordt gebruikt om afwijkingen in te identificerenallevan uw genen, zelfs als deze afwijkingen niet eerder in verband zijn gebracht met een ziekte. Het is bijvoorbeeld niet de juiste test om te zoeken naar een specifieke genafwijking, zoals de geïdentificeerde genen in relatie tot borstkanker.
kasto80 / Getty Images
Hoe genen werken
WES kan worden gebruikt om patronen te zoeken om de genetische oorzaak van een medische ziekte te vinden. Uw chromosomen zijn moleculen die uw genetische code bevatten. (Je hebt 23 paar chromosomen - deze worden ook wel DNA-moleculen genoemd.) Ze zijn samengesteld uit lange strengen nucleotidemoleculen. Je lichaam leest de volgorde van de nucleotiden op je chromosomen om eiwitten te produceren.
Veranderingen in de nucleotidesequentie in DNA-moleculen zijn verantwoordelijk voor de variaties in eigenschappen onder ons allemaal.
Veranderingen die ziekte veroorzaken, worden vaak mutaties genoemd.
Het helpt om een aantal basisprincipes van genetica te begrijpen als u overweegt WES te gebruiken.
Genen en genomen
Alle eigenschappen van uw lichaam worden gevormd door de productie van eiwitten. Genen zijn nucleotidesequenties die coderen voor de eiwitten die uiteindelijk uw eigenschappen produceren. Alle genetische codering van al uw 46 chromosomen wordt uw genoom genoemd.
Exons
De nucleotide-secties van een DNA-molecuul die coderen voor genen, worden exons genoemd. Ze worden afgewisseld met introns, die nucleotidesequenties zijncodeer niet voor eigenschappenEen enkel gen kan zijn samengesteld uit verschillende exons die coderen voor meerdere eiwitten. Exons zijn goed voor slechts 1 tot 2 procent van uw totale DNA.
Elk exon begint eigenlijk met een nucleotidesequentie die de eiwitproductie aanzet en eindigt met een nucleotidesequentie die de beëindiging van de eiwitproductie veroorzaakt.
Exome
Alle exons in je hele set chromosomen worden het exoom genoemd. Bij de sequentiebepaling van het hele exoom wordt naar uw hele exoom gekeken om afwijkingen te identificeren die verantwoordelijk kunnen zijn voor een ziekte of een gezondheidsprobleem.
Beperkingen
WES is vrij uitgebreid, en het onderzoekt alle genen in je lichaam. Het onderzoekt echter helemaal geen introns. Aangenomen wordt dat introns enig effect kunnen hebben op uw lichaam, hoewel dat effect niet volledig wordt begrepen en momenteel niet zo invloedrijk wordt geacht als de invloed van exons.
Werkwijze
WES gebruikt een bloedmonster om uw genomen te analyseren. Elke cel in uw lichaam bevat een volledige kopie van al uw 46 chromosomen, dus bloedcellen zijn voldoende voor dit type test.
WES-tests gebruiken een moleculaire techniek genaamd hybridisatie, die de nucleotidesequentie van het bemonsterde DNA vergelijkt met een standaard of "normale" DNA-sequentie.
WES kan mutaties oppikken waarvan al bekend is dat ze ziekten veroorzaken, en het kan ook veranderingen in de genetische code detecteren die nog niet in verband zijn gebracht met een ziekte.
Waar u kunt worden getest
Er zijn veel laboratoria die hele exome-sequencing uitvoeren. Als uw arts wil dat u de volledige exome-sequencing laat uitvoeren, kunt u uw bloed laten afnemen op het kantoor van uw arts en kan het monster voor interpretatie naar een gespecialiseerd laboratorium worden gestuurd.
Als u de test krijgt zonder doktersvoorschrift, kunt u contact opnemen met een gespecialiseerd laboratorium dat rechtstreeks WES-tests uitvoert en hen om instructies vragen.
Kosten
Het is belangrijk dat u de kosten van testen controleert, en ook controleert of uw ziektekostenverzekering de kosten van de test dekt. WES is een relatief nieuw type technologie en uw verzekeringsmaatschappij kan de kosten al dan niet dekken, afhankelijk van hun polissen.
Als u van plan bent om zelf voor de test te betalen, kunnen de kosten variëren tussen $ 400 en $ 1.500.
Overwegingen
Als u of uw kind een volledige genomische sequentiebepaling gaat ondergaan, moet u zich bewust zijn van de implicaties. Er zijn een aantal dingen waarmee u rekening moet houden voordat u WES ondergaat.
Privacy
Uw genetische resultaten kunnen een onderdeel worden van uw medisch dossier, vooral als een arts uw test bestelt en als uw ziektekostenverzekering ervoor betaalt. Uw ziektekostenverzekeraar, het bedrijf dat de test uitvoert en mogelijk een van hun leveranciers (of iemand die hackt in hun computersystemen), kunnen erachter komen of u de genen voor een bekende genetische eigenschap draagt.
Aangezien dit genetische tests zijn, zijn er implicaties die ook van invloed kunnen zijn op mensen die aan u verwant zijn. Hoewel er wetten zijn om uw privacy te beschermen en voorschriften die voorkomen dat reeds bestaande aandoeningen uw gezondheidsdekking beïnvloeden, is dit informatieniveau ongekend. Er kunnen onverwachte persoonlijke en professionele resultaten zijn op het gebied van privacy.
Bewustzijn van vatbaarheid voor ziekten
Velen zijn bang dat genomische tests meer over hun gezondheid zullen onthullen dan waar ze aanvankelijk op hadden gerekend. Behalve in uiterst zeldzame gevallen - zoals de ziekte van Huntington - onthullen genetische tests de medische toekomst van een persoon niet.
Het heeft de potentie om in de meeste gevallen te onthullen dat een persoon een verhoogd risico heeft op verschillende medische aandoeningen. Omdat een persoon zo grondig wordt getest, kunnen er enkele afwijkingen worden ontdekt. Velen zullen echter nooit tot een specifieke ziekte of aandoening leiden.
In deze fase van ontdekking is het waarschijnlijk dat niemand ooit zou kunnen onderscheiden wat de exacte medische implicaties zijn voor iemands toekomst, of welke "afwijkingen" bijvoorbeeld tot een bepaalde ziekte of aandoening zullen leiden.
Beslissen over een test
Er zijn verschillende vergelijkbare genetische tests die uw chromosomen anders evalueren dan WES, en er zijn voor- en nadelen aan elk type test.
Chromosomale analyse
Chromosomale analyse wordt ook karyotypering beschreven. Deze test kan al uw chromosomen analyseren om te zien of er veranderingen zijn, zoals een extra kopie van een chromosoom of een ontbrekend chromosoom.
Chromosomale testen kunnen ook substantiële veranderingen in de chromosoomstructuur detecteren, zoals langwerpige of korte chromosomen.
Karyotypering kan aandoeningen identificeren zoals het syndroom van Down, waarbij een extra kopie van chromosoom 21 aanwezig is. Het kan echter geen kleine mutaties in een gen detecteren.
Gehele genomische sequentie
Een hele genomische sequentie is vergelijkbaar met sequentiebepaling van het hele exoom, behalve dat het uitgebreider is. Het kijkt naar het hele genoom, inclusief de intronsequenties. De volledige genomische sequentiebepaling is ook duurder dan de volledige exoomsequentiebepaling.
Moleculair genetische tests
Deze onderzoeken, ook wel microarray-genetische tests genoemd, vergelijken een klein deel van uw DNA met bekende genen of met een geselecteerde DNA-sequentie om veranderingen of bekende mutaties in een specifiek gebied op een chromosoom te vinden.
Deze tests zijn nuttig als u symptomen heeft van een aandoening die wordt veroorzaakt door een mutatie op een bekende locatie van een chromosoom, zoals de genen voor de ziekte van Huntington en sommige genen voor borstkanker.
Een woord van Verywell
WES is nog een relatief nieuwe methode van genetisch testen en het is nog niet helemaal duidelijk hoe deze het beste in de praktijk kan worden toegepast.
Er zijn ernstige problemen waarmee u rekening moet houden als u of een dierbare een genetische test ondergaat. Als de behandeling van een vermoedelijke genetische aandoening is afgestemd op het genetisch defect, heeft u mogelijk veel te winnen bij de test. Zelfs als de test geen invloed heeft op uw behandeling, kunnen de resultaten nuttig zijn om uw prognose te begrijpen en om familieleden te laten weten dat ze mogelijk risico lopen. Denk goed na over hoe u op normale of abnormale resultaten zult reageren en overweeg zorgvuldig uw privacy voordat u de test uitvoert.
Hoe genomisch testen ziekten aan het licht brengt
.jpg)
